L’agriculture, dont on peut inclure la pêche, la chasse et la sylviculture, est le premier secteur d’activité sur l’île d’Anjouan et aux Comores. Elle représente 40 % du PIB, emploie 80 % de la main d’oeuvre, et prend la première place dans les exportations. L’Union ne suffit pas à ses propres besoins en ce qui concerne la nourriture; le riz, produit principal, représente la majorité des importations. Le gouvernement investit dans la modernisation de la formation technique et de l’éducation, afin de privatiser les entreprises commerciales et industrielles, d’améliorer les services de santé, diversifier l’exportation, faire la promotion du tourisme et réduire le taux élevé de croissance de la population.

L’économie d’Anjouan, qui est peut être financièrement la plus forte des trois îles, est centrée sur l’exportation de vanille, d’huile d’ylang-ylang, fleurs d’oranger, huiles parfumées, et clous de girofle. Anjouan est le premier producteur mondial d’huile d’ylang-ylang, la base de tous les parfums.

Le tourisme est un secteur d’activité qui fournit de plus en plus de recettes. Grâce aux projets de développer les infrastructures touristiques, il est très probable que, dans quelques années, le tourisme prenne une place plus importante dans le PIB de l’île.

Anjouan n’a pas de ressource naturelle en tant que telle, bien que l’île suffise à ses propres besoins d’énergie, et qu’il y ait une centrale hydroélectrique à Marahani. On prévoit la construction de nouvelles centrales électriques à Anjouan, ce qui aura un effet bénéfique pour l’industrie et l’emploi.

N’étant qu’un centre offshore peu connu, Anjouan peut également se permettre d’être flexible et proactive. On obtient facilement et rapidement des responsables du gouvernement les réponses sur les projets d’affaires qui ont été proposés. Avec la création d’un centre offshore, Anjouan est déterminée à se voir considérée comme le futur environnement fertile où il sera bon de commercer. On espère que grâce à la nouvelle Autorité Financière Offshore, l’île connaîtra un avenir financier très prometteur.

L’unité monétaire dans l’Union est le Franc comorien, lié dans le passé au Franc Français et indexé depuis janvier 1999 à l’Euro, un Euro représentant 491,9677 Francs Comoriens. L’Euro est la monnaie courante dans les affaires.